Sau đây là những bệnh hoặc biến chứng quan trọng nhất có thể do bệnh Whipple gây ra:
Mắt và các phần phụ của mắt (H00-H59).
- Viêm màng bồ đào - viêm mắt giữa da.
Hệ tim mạch (I00-I99)
- Viêm nội tâm mạc (viêm màng trong tim; vị trí phổ biến thứ hai).
- Viêm cơ tim (viêm của tim cơ bắp).
- Viêm màng ngoài tim (viêm của ngoại tâm mạc) với suy van.
Hệ thống cơ xương và mô liên kết (M00-M99).
- Viêm đa khớp (viêm nhiều khớp).
- Viêm bao hoạt dịch (viêm màng hoạt dịch)
Psyche - hệ thần kinh (F00-F99; G00-G99)
- Chứng hay quên (mất trí nhớ)
- Ataxia (rối loạn dáng đi)
- Nhìn tê liệt
- Chứng sa sút trí tuệ
- Động kinh (co giật)
- Nhịp điệu ngủ-thức bị xáo trộn
Các triệu chứng và các phát hiện bất thường trong phòng thí nghiệm và lâm sàng không được phân loại ở nơi khác (R00-R99).
- Bệnh phổi (viêm màng phổi).